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技術(shù)文章

抗體使用常見(jiàn)問(wèn)題解答點(diǎn)擊次數(shù):2515 更新時(shí)間:2010-01-19

 

使用抗體常見(jiàn)問(wèn)題解答

1
、如何選擇合適的一抗?

請(qǐng)先確定您要檢測(cè)的種屬和使用的實(shí)驗(yàn)方法,然后查找相關(guān)產(chǎn)品,根據(jù)說(shuō)明書(shū)上描述的“適用種屬和實(shí)驗(yàn)方法”來(lái)確定合適的抗體。如果說(shuō)明書(shū)中有明確您要檢測(cè)的種屬和實(shí)驗(yàn)方法均經(jīng)過(guò)檢測(cè),則您可以放心地購(gòu)買該產(chǎn)品。
2、如何選擇合適的二抗?

二抗的選擇原則:

  • 針對(duì)一抗來(lái)源的二抗(比如一抗是小鼠來(lái)源的,二抗就要是抗小鼠的)
  • 針對(duì)一抗Ig亞型的(比如一抗是IgM,二抗就要是抗IgM的抗體)
  • 為了增加特異性、降低背景:可以選擇Fab段的抗體(去除Fc段的)、經(jīng)過(guò)標(biāo)本來(lái)源種屬血清吸附的的二抗
  • 查看二抗的說(shuō)明書(shū),選擇經(jīng)過(guò)驗(yàn)證可以用于相應(yīng)實(shí)驗(yàn)方法的二抗

3 如何選擇同型對(duì)照?

同型對(duì)照的主要目的是確定一抗的結(jié)合是特異性的,而不是非特異性的Fc受體或與其他蛋白的相互作用。同型對(duì)照要與一抗的來(lái)源、Ig分型和標(biāo)記*一致。例如:一抗是FITC標(biāo)記,其抗體分型是小鼠的IgG1,則同型對(duì)照要選擇是FITC標(biāo)記的小鼠的IgG1。

多抗的同型對(duì)照:

絕大部分的同型對(duì)照產(chǎn)品都是單克隆抗體,因此不適用于作為多克隆抗體的對(duì)照(因?yàn)槎嗫购卸喾NIgG的亞型)。
4、如何選擇陽(yáng)性對(duì)照?

陽(yáng)性對(duì)照的使用是一個(gè)實(shí)驗(yàn)中確定抗體及檢測(cè)系統(tǒng)是否正常工作的依據(jù),也是確定待測(cè)標(biāo)本中是否存在待測(cè)蛋白的一個(gè)依據(jù)!尤其是檢測(cè)的標(biāo)本是不確定是否有待測(cè)蛋白表達(dá)時(shí)。因此當(dāng)實(shí)驗(yàn)沒(méi)有陽(yáng)性結(jié)果出現(xiàn)時(shí),的選擇是實(shí)驗(yàn)合適的陽(yáng)性對(duì)照。

說(shuō)明書(shū)上都有推薦的陽(yáng)性對(duì)照。但是如果說(shuō)明書(shū)上沒(méi)有推薦時(shí),請(qǐng)參考以下條款:

  • 看看說(shuō)明書(shū)中是否有Abreviews。任何被其他客戶成功檢測(cè)的組織、細(xì)胞或者裂解物均可以作為合適的陽(yáng)性對(duì)照!
  • 根據(jù)說(shuō)明書(shū)上的Swiss-Prot 或 Omnigene 數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)查找。這些數(shù)據(jù)庫(kù)經(jīng)常會(huì)列出該蛋白表達(dá)的組織,這也可以作為合適的陽(yáng)性對(duì)照!
  • 查查該蛋白的GeneCards 吧,這里通常會(huì)有蛋白在不同組織的表達(dá)水平。
  • 如果上述方法還是不能找到合適的陽(yáng)性對(duì)照,推薦您去PubMed 查查發(fā)表文章,看看有無(wú)文章報(bào)道該蛋白表達(dá)的細(xì)胞和組織

5、如何確定一抗的稀釋比例?

如果說(shuō)明書(shū)中有推薦的稀釋比例,請(qǐng)按照該稀釋比例進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。但是由于標(biāo)本類型、實(shí)驗(yàn)條件、操作環(huán)境等各種因素的影響,推薦濃度僅作為參考。實(shí)驗(yàn)者需要在推薦濃度周圍進(jìn)行多個(gè)濃度梯度的實(shí)驗(yàn),從中發(fā)現(xiàn)*的稀釋比例。

如果說(shuō)明書(shū)沒(méi)有推薦稀釋比例,僅注明“Use at an assay dependent dilution”,就需要做大量的預(yù)實(shí)驗(yàn)來(lái)摸索*的比例了。下表列出的純化抗體抗體用于不同實(shí)驗(yàn)方法時(shí)常用的工作濃度,可以作為預(yù)實(shí)驗(yàn)的參考。未純化的抗體一般在說(shuō)明書(shū)中不會(huì)標(biāo)明抗體的濃度,因?yàn)榇蟛糠秩寡?、培養(yǎng)上清或腹水形式的產(chǎn)品濃度都是沒(méi)有經(jīng)過(guò)測(cè)定的。如果未純化抗體產(chǎn)品的說(shuō)明書(shū)中沒(méi)有標(biāo)明其中特異性抗體的濃度,實(shí)驗(yàn)者可以參考下表中“估計(jì)濃度”確定各種實(shí)驗(yàn)稀釋比例。

請(qǐng)記住,下表中的各種稀釋比例和工作濃度僅僅是作為一個(gè)起始點(diǎn),需要根據(jù)試驗(yàn)結(jié)果來(lái)進(jìn)行適當(dāng)?shù)恼{(diào)整。以此起點(diǎn)作一系列的濃度,從中確定*的工作濃度和稀釋比例!

 
組織培養(yǎng)上清
腹水
全抗血清
純化抗體
WB / dot blot
1/100
1/1000
1/500
1 ug/ml
IHC / ICC
neat - 1/10
1/100
1/50 - 1/100
5 ug/ml
EIA / ELISA
1/1000
1/10000
1/5000
0.1 ug/ml
FC
1/100
1/1000
1/500
1 ug/ml
IP
 
1/100
1/50-1/100
1 - 10 ug/ml
Concentration estimate
1 - 3 mg/ml
5 - 10 mg/ml
1 - 10 mg/ml
 

6、如何確定適用于某種特定抗體的抗原修復(fù)方法?

有些抗體對(duì)抗原修復(fù)方式有特別要求的,一般在其說(shuō)明書(shū)中都會(huì)有明確的標(biāo)注和推薦。但是很多抗體并沒(méi)有一個(gè)特別的推薦,就需要實(shí)驗(yàn)者自己來(lái)進(jìn)行優(yōu)化和摸索了。
7、為何實(shí)際檢測(cè)到的WB條帶與預(yù)期的有所區(qū)別?

WB是根據(jù)蛋白質(zhì)的大小來(lái)分離蛋白的,通常小分子量蛋白在凝膠中的遷移速度要快。但是遷移率也是受到其他因素影響的,這就造成了實(shí)際檢測(cè)到的條帶與預(yù)期條帶的不一致。主要有以下幾種常見(jiàn)因素:

  • 翻譯后修飾-比如磷酸化、糖基化等,這些修飾會(huì)增加蛋白質(zhì)的分子量
  • 翻譯后剪切- 比如很多蛋白是以前體蛋白的形式合成的,在執(zhí)行功能時(shí)需要進(jìn)行剪切成活化的形式,如pro-caspases
  • 不同剪切體 – 有些來(lái)源于同一基因的蛋白有不同的剪切方式,每個(gè)剪切方式得到的蛋白大小都是不同的
  • 相對(duì)電荷(Relative charge – 氨基酸的組成(charged vs non-charged)
  • 多聚體-如二聚體或三聚體。這些多聚體的形式通常會(huì)抵制WB時(shí)所做的還原條件,因此造成檢測(cè)的條帶偏大。

 

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